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非水溶剂具有毒性、可燃性、可爆性等问题，因此在使用有机溶剂时有一定的局限性，应力求做到安全使用。
非水溶剂的毒性，即非水溶剂的蒸气被人体吸入，或制剂被人体接触后，引起人体的局部刺激和麻醉作用，从而使人体器官的某些功能受到损害。为了防止非水溶剂蒸气通过呼吸途径进入人体，在作业过程中所使用的设备最好是密闭式的并且环境有良好的通风条件，以降低空气中有毒溶剂蒸气的浓度。现场人员应戴防护口罩或面罩。通过口腔进入人体，即误服非水溶剂时应尽快采取催吐、洗胃及其他必要的措施。
溶剂的可燃性，即非水溶剂都是易燃的。因此在储存和使用非水溶剂时，都应该采取严格的防范措施并且了解溶剂的闪点、燃点、自燃点等性质。闪点是液体的表面蒸气与空气和火接触，初次发生蓝色火焰的最低温度;燃点是指溶剂的表面蒸气与空气和火焰接触，发生燃烧且持续燃烧不少于5s的温度;自燃点是指物质在无火焰接近时自行燃烧的温度，通常是由迟缓的氧化作用所引起的。
溶剂具有可爆性，即溶剂的表面蒸气与空气形成的混合物中，溶剂的浓度达到一定范围时，在一定的温度和压力下，可能发生燃烧或爆炸。这种能发生着火或爆炸的浓度范围称为燃烧范围或爆炸范围。当溶剂的浓度高于或低于这个浓度范围时，都不会发生爆炸。在溶剂生产、储存、运输和使用时，必须注意其爆炸范围，并注意避开火源，场所应良好通风，及时消除静电，配置消防器材等。